Analisis sistem IgG plasma N-glikopeptida utuh dari pasien dengan penyakit ginjal kronis melalui EThcD-sceHCD-MS/MS

Molekul imunoglobulin G (IgG) memodulasi respon imun. Namun, khusus situs nTanda-tanda glikosilasi IgG plasma pada pasien dengan penyakit ginjal kronis (CKD) masih belum jelas. Penelitian ini bertujuan untuk mengusulkan metode baru untuk mengeksplorasi n-pola glikosilasi IgG dan membandingkannya dengan metode yang dilaporkan. Kami memisahkan IgG plasma manusia dari 58 kontrol sehat (HC) dan 111 pasien dengan CKD. Molekul IgG yang dimurnikan dicerna oleh tripsin. Peptida triptik tanpa pengayaan utuh n-glikopeptida dianalisis menggunakan kombinasi transfer elektron/energi tinggi disosiasi tumbukan (EThcD) dan energi tumbukan bertahap/disosiasi tumbukan energi tinggi (sceHCD) spektrometri massa (EThcD-sceHCD-MS/MS). Ini menghasilkan kualitas spektral yang lebih tinggi, ion fragmen yang lebih informatif, skor Byonic yang lebih tinggi, dan hampir dua kali kedalaman utuh nidentifikasi -glikopeptida daripada sceHCD atau EThcD saja. Khusus situs n-pemetaan glikosilasi mengungkapkan bahwa utuh n-glikopeptida diekspresikan secara berbeda pada pasien HC dan CKD; dengan demikian, ini bisa menjadi alat diagnostik. Penelitian ini menyediakan metode untuk penentuan pola glikosilasi pada CKD dan kerangka kerja untuk memahami peran IgG dalam patofisiologi CKD. Data tersedia melalui ProteomeXchange dengan pengenal PXD027174.