Disosiasi kompleks protein yang diinduksi permukaan pada spektrometer mobilitas ion siklik

Kami menjelaskan implementasi sel disosiasi yang diinduksi permukaan (SID) tiga elektroda sederhana pada spektrometer mobilitas ion siklik (cIMS) dan menunjukkan kegunaan pemisahan mobilitas multipass untuk menyelesaikan beberapa konformasi kompleks protein yang dihasilkan selama tumbukan yang diinduksi dan permukaan- percobaan terinduksi berlangsung (CIU & SIU). Selain CIU dan SIU, SID kompleks protein mudah dicapai dalam perangkat lunak instrumen asli dan tanpa catu daya eksternal tambahan dengan memasukkan energi tumbukan SID tunggal, penyederhanaan dalam pengalaman pengguna dibandingkan dengan implementasi sebelumnya. Satu set kompleks protein homomerik siklik dan heterohexamer dengan perilaku CID dan SID yang diketahui dianalisis untuk menyelidiki peningkatan resolusi massa dan mobilitas, yang terakhir meningkat sebesar 20–50% (median: 33%) dibandingkan dengan perangkat gelombang perjalanan linier. Beberapa lintasan kompleks utuh, atau fragmen SID-nya, meningkatkan resolusi mobilitas rata-rata 15% per lintasan, dengan efek lintasan balap diamati setelah 3 atau 4 lintasan, tergantung pada penyebaran waktu drift dari analit. Bahkan dengan peningkatan sederhana pada daya penyelesaian mobilitas yang nyata, eksperimen multipass sangat berguna untuk memisahkan konformasi yang dihasilkan dari eksperimen CIU dan SIU. Kami mengilustrasikan beberapa contoh di mana (1) eksperimen multipass mengungkapkan beberapa konformasi tumpang tindih yang sebelumnya tidak teramati atau dikaburkan karena resolusi mobilitas terbatas, atau (2) konformasi CIU atau SIU yang muncul ‘asli’ dalam eksperimen single pass sebenarnya sedikit dipadatkan atau diperluas, dengan perubahan yang hanya dapat diukur melalui eksperimen multipass. Pekerjaan yang dilakukan di sini, pemanfaatan pertama mobilitas ion siklik multipass untuk CIU, SIU, dan SID rakitan protein dan demonstrasi alur kerja SIU/SID yang sepenuhnya terintegrasi, membuka jalan bagi adopsi luas teknologi SID untuk spektrometri massa asli dan juga meningkatkan pemahaman kita tentang CIU kompleks protein fase gas dan konformasi SIU.