Penentuan struktural de novo isomer oligosakarida dalam glikosfingolipid menggunakan spektrometri massa tandem urutan yang diturunkan secara logis

Terlepas dari pentingnya karbohidrat dalam sistem biologis, penentuan struktural karbohidrat tetap sulit karena banyaknya jumlah isomer. Dalam penelitian ini, metode spektrometri massa baru, yaitu spektrometri massa tandem urutan yang diturunkan secara logis (LODES/MSⁿ), dikembangkan untuk mengkarakterisasi struktur oligosakarida. Dalam pendekatan ini, sekuensial collision-induced disociation (CID) oligosakarida dilakukan dalam spektrometer massa perangkap ion untuk mengidentifikasi posisi keterkaitan, konfigurasi anomer, dan stereoisomer dari masing-masing monosakarida dalam oligosakarida. Urutan CID berasal dari mekanisme disosiasi karbohidrat. LODES/MSⁿ tidak memerlukan standar oligosakarida atau pengetahuan sebelumnya tentang aturan dan prinsip jalur biosintetik; jadi LODES/MSⁿ sangat berguna untuk penyelidikan oligosakarida yang belum ditemukan. Kami menunjukkan bahwa struktur oligosakarida inti dalam glikosfingolipid dapat diidentifikasi dari lebih dari 500.000 isomer menggunakan LODES/MSⁿ. Metode yang sama dapat diterapkan untuk menentukan struktur oligosakarida lain, seperti: n-, dan HAI-glikan, dan oligosakarida bebas dalam susu.